Его отец, мичман Фанис Ишмуратов, погиб в 26 лет во время катастрофы «Курска». Сына похоронят рядом с ним.
Денис рассказывал в интервью, что планирует получить звание офицера. Мать поддержала решение сына сказав, что тот «продолжит службу отца».
Новость о гибели Даниса Ишмуратова в Украине появилась в тематической группе «Штурм глубины. Подводные лодки» в «Вконтакте». Обстоятельства его смерти неизвестны.